Los principios de trabajo que se han establecido para el cumplimiento del proyecto de "Incidencia e investigación en política ambiental", se insertan dentro de la estrategia global de trabajo de la UICN. Ésta consiste en colocar el conocimiento al servicio de las personas y las instituciones, para que puedan participar e incidir más efectivamente en procesos de toma de decisión para mejorar las leyes, políticas, instrumentos e instituciones, esto es la interacción del conocimiento, el empoderamiento y la gobernanza

Asimismo, para ejecutar las acciones propuestas por el proyecto se ha establecido un Comité Directivo, un Comité Evaluador, la Unidad de Administración del Fondo de Investigación e Incidencia y la Unidad de Evaluación y Monitoreo.

• Comité Directivo: está conformado por un/a representante de la UICN, un/a representante de la Embajada Real de Dinamarca y un/a representante de la embajada de Noruega. Será el encargado de aprobar, monitorear y discutir todo lo referente a los presupuestos, planes e informes del proyecto.

• Comité Evaluador: estará integrado por el o la Presidenta del Comité Mesoamericano de Miembros de la UICN, un/a representante regional del sector privado, un/a representante de la Embajada de Dinamarca en la región, un/a representante de la Comisión Centroamericana de Ambiente y Desarrollo y un/a representante de una organización regional de la sociedad civil que represente intereses de grupos de base. Su principal función es la de seleccionar las propuestas que se presenten al Fondo.

• Unidad de Administración del Fondo de Investigación e Incidencia: tendrá entre otras funciones, capacitar a las organizaciones de la sociedad civil seleccionadas sobre sistemas de rendición de cuenta y brindar apoyo técnico financiero a las organizaciones que lo necesiten para ejecutar el proyecto.

• Unidad de Evaluación y Monitoreo: será responsable de evaluar los impactos que los proyectos financiados tienen en la región y proponer medidas correctivas para proyectos en marcha.